Perairan Kabupaten Supiori memiliki potensi perikanan yang sangat besar, dimana terdapat berbagai jenis komoditi hasil laut yang bernilai ekonomis tinggi antara lain :

Berbagai jenis ikan pelagis seperti tuna mata besar (Thunnus obesus), tuna ekor kuning (Thunnus albacores), cakalang (Katsuwonus pelamis), tongkol (Auxis thazard), tenggiri (Scomberomorus sp), dan jenis ikan pelagis kecil lainnya.